国宝の本殿は、藤原時代の一間社流造りであり現存する最古の神社本殿。この宇治の中にあって宇治上神社は平等院とともに世界遺産に登録されている。

鎌倉時代初めの建築物である拝殿もまた国宝であり、こちらも現存する最古の拝殿である。

境内には宇治七名水の1つ 桐原水が湧き出ている。